Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Scn4aQ9ER60 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn4aQ9ER60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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