Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms