Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms