Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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