Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms