Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms