Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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