Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms