Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pus10Q9D3U0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms