Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms