Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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