Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms