Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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