Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms