Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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