Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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