Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms