Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot11Q9CWN7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms