Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms