Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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