Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms