Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms