Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms