Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim26Q99PN3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms