Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn6Q99PL6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubxn6Q99PL6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms