Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rtn4rQ99PI8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rtn4rQ99PI8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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