Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NsmfQ99NF2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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NsmfQ99NF2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NsmfQ99NF2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NsmfQ99NF2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NsmfQ99NF2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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