Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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