Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms