Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp11Q99K46 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp11Q99K46 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp11Q99K46 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp11Q99K46 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp11Q99K46 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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