Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GatbQ99JT1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms