Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl1Q99J56 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl1Q99J56 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms