Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PpcsQ8VDG5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms