Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Sft2d2Q8VD57 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Sft2d2Q8VD57 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d2Q8VD57 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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