Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cchcr1Q8K2I2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cchcr1Q8K2I2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cchcr1Q8K2I2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cchcr1Q8K2I2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cchcr1Q8K2I2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cchcr1Q8K2I2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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