Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Abcf3Q8K268 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Abcf3Q8K268 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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