Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrit1Q8K099 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrit1Q8K099 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrit1Q8K099 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrit1Q8K099 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Lrit1Q8K099 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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