Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mterf1aQ8CHZ9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms