Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Upp2Q8CGR7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms