Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brf1Q8CFK2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Brf1Q8CFK2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Brf1Q8CFK2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Brf1Q8CFK2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms