Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms