Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms