Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufl1Q8CCJ3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms