Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubqln3Q8C5U9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms