Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TdrpQ8C5P7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TdrpQ8C5P7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TdrpQ8C5P7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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