Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms