Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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