Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Susd4Q8BH32 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd4Q8BH32 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms