Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms