Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms